如今看着港口内的这一支拥有七十八艘各类战舰，以及近百艘武装商船和大量纵火船的舰队，苏禄省总督奎瓦放心多了。自从无敌舰队远征失败之后，西班牙国力每况愈下，他已经很久没有看到如此庞大的舰队停靠马尼拉港了。
庞大的舰队让马尼拉港有了安全保障，而唯一令奎瓦总督有些烦恼的，就是拥有舰队中四十艘战舰的尼德兰舰队司令德鲍尔非要争总指挥权。本来按照西班牙人的打算，他们是这次联合舰队的发起国，又对各国许下了诸多利益，西班牙舰队司令布拉班特公爵当然成为联合舰队的指挥官。然而荷兰舰队司令德鲍尔仗着己方舰队达到全舰队半数以上，要求成为总指挥官。
双方针锋相对谁也不肯相让，而英国人因为与尼德兰的盟友关系，选择支持德鲍尔，葡萄牙人因为奉腓力四世为国王，选择支持西班牙，双方大会吵小会闹，最终布拉班特公爵以答应将缴获的所有巨舰（宝船）全都归尼德兰所有，这才获得了指挥权。
这场纷争表面上是争夺舰队指挥权，实际上则是西班牙与尼德兰的幕后博弈，这两个互相看不顺眼的国家，从一开始就是各怀鬼胎的。整个联合舰队虽然看似强大无比，实际上却分成了西班牙与葡萄牙，以及尼德兰与英国的两方势力，他们彼此之间有着很深的矛盾，互相之间只是利益的结合。
就在这样力量尚未整合的时候，哨戒舰传来了消息，唐军本土舰队共计四十二艘战舰，正在向着马尼拉港驶来。各国的军官无不是海上老手，他们深知舰队被堵在海港中的可怕，尽管对方还有两天路程才能抵达，布拉班特公爵还是决定全舰队立即起航，向着对方的前进方向主动迎了上去。
联合舰队拥有三百艘各类船只组成的庞大舰队，其中尼德兰人的势力最大，拥有四十艘战舰和三十七艘武装商船，西班牙人次之，拥有十九艘战舰和三十九艘商船，葡萄牙人也是竭尽全力，从亚洲各地抽调了十一艘战舰和二十七艘武装商船。
如果单论数量，英国人的船只是最多的，不过他们手中最多的是一百一十艘纵火船，这种小船作战都是一次性使用的，实际上等同于敢死队，其作战能力有限，只能在混战中给予敌人打击。真正有战斗的英国战舰只有八艘，另有武装商船十二艘而已，可以说是各国舰队中最小的一支力量。
除此之外还有个更加麻烦的问题，那就是各国的战舰规制并不相同，作战理念也不一样，如果直接整合在一起，很难发挥出作战力量。其中西班牙人和尼德兰人的战舰理念差不多，
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