武德九年，六月初四庚申日，秦王率长孙无忌、尉迟恭、侯君集、张公谨、刘师立、公孙武达、独孤彦云、杜君绰、郑仁泰、李孟尝等人入朝，并在玄武门埋下伏兵。李建成、李元吉二人不知底细，也一起入朝，骑马奔向玄武门。李建成、李元吉来到临湖殿，惊觉有变，立即掉转马头，准备返回东宫和齐王府。
秦王跟在后面大唤齐王李元吉名讳，李元吉心虚，便先搭箭射向秦王，却因心急，一连两三次都没将弓拉满，失了准头。秦王深吸一口气，对准了李建成，满弓射出长箭一支，李建成回弓却未能打落疾矢，中箭身亡。
随后尉迟恭带领骑兵七十人相继赶到，助秦王一臂之力。然此时，秦王坐骑突然受惊，带着秦王奔入玄武门一旁的树林，将其摔下马背，正巧此时李元吉追赶而来，冲上前欲勒死秦王。好在尉迟恭跃马奔来大声喝止了李元吉，李元吉自知不是尉迟恭对手，忙放开秦王，想跑入武德殿寻求父皇庇护，但却被尉迟恭快马追上，中箭身亡。
政变之时，李渊正在宫内的海池上划船，对内情并不明了。
太子和齐王中箭后，李玄霸便趁机回了秦王府，褪下了一身铠甲，换上了布衣，留下书信一封，不辞而别。
而在暗中修养多时的李世民则换上了戎装，进宫复命。
李渊见到李世民一脸悲痛，哭道太子叛变被诛，这才得知政变巨细，痛哭流涕，而后便重立李世民为太子。又以高士廉为侍中，房乔为中书令，萧?为左仆射，长孙无忌为吏部尚书，杜如晦为兵部尚书。
七月，高祖将亲笔诏书赐给裴寂等人说：“朕当加太上皇尊号。”名言了退位和内禅的想法。至此便销了太子李世民兼任的天策上将府邸，为李世民登基做准备。
九月，高祖颁布制书，将皇帝位传给了李世民，仍暂居于大内皇宫正殿太极殿。李世民推辞再三而高祖不许。第二日，即武德九年八月初九甲子日，太子李世民便在东宫显德殿即皇帝位，是为唐太宗，并大赦天下。
六年过去，而今天下安定，党派之争也近乎落下帷幕，房乔在李世民登基第二日，便写好了辞官文书，到了太极殿上。
“师父，你岂能离去！”李世民读完这信，顿时变了脸色。这天下初定，他身边众人可靠的又没有几个，他岂能任房乔撤手离去？
“莫要再叫我师父，这二字我担不起。我欠了一个人六年，该走了。”
“师父……”
“圣上折煞微臣了。”
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