三月，明廷重新设立辽东巡抚，并以袁崇焕担任。自宁远大捷，捷书闻，举朝大喜，明熹宗立擢崇焕右佥都御史，子孙世荫锦衣千户，驻宁远。祖大寿以军功升副总兵，驻锦州。同战立下赫马功劳的满桂被明熹宗褒赏，擢都督同知，实授总兵官。再论功，加右都督，荫副千户，世袭。桂疏谢，并自叙前后功。优诏褒答，再进左都督。而经略高第及杨麟因为不发援军被罢官，明廷以王之臣和赵率教将其替代。
初五日，明熹宗特遣内臣监军，魏忠贤派其党羽刘应坤镇守山海关。大学士顾秉谦、丁绍轼、黄立极、冯铨、兵部尚书王永光谏止，熹宗以成祖已有旧制，且为恢复封疆之大事，皆不听。袁崇焕上疏请求将其调离，但遭拒绝。
其实朱由校任用太监督军一事，已并非是稀奇事。孙承宗还在任辽东督师时，明熹宗便喜欢视察边关，常派遣东厂之人到关门，然后将边关之事奏报给朝廷。熹宗继位之初，就将乳母客氏封为奉圣夫人，颇为优容。时东林党人担心客氏干政，上谏驱逐客氏出宫。客氏便与魏忠贤狼狈为奸，反击东林党人，才致使阉党一时间擅权弄政，厂卫横行。
魏忠贤此人又格外奸滑，执掌东厂后，便利用阉党的势力与风头正盛的东林党相制衡。
明熹宗闲来无事时，就喜欢在皇宫里头自己动手做些木工，可谓是入了魔，终年不倦。魏忠贤便逮住机会，每逢熹宗做木工时，便假意奏事，惹得熹宗厌烦，不肯听下去，推说自己已经都清楚了，你们看着办就行。于是魏忠贤借机多次矫诏擅权，排挤东林党人，东厂番子横行不法，奸佞当道。
不久，袁崇焕与大将满桂闹不和，于是袁崇焕上疏请求将满桂调往别处，明廷于是召满桂回朝。经略王之臣奏书请求留住满桂，袁崇焕又因此与王之臣闹不和。前有经抚不和的教训，明熹宗担心二人的矛盾会影响守辽之事，遂决定将两人分开，命王之臣督关内，而袁崇焕守关外。
努\尔哈赤这边伤势渐愈，在宁远吃了“红夷大炮”的亏后，便整修舟车，闭门造车，一门心思试演火器。不仅设立了火器堂，还派人赶工仿造出了类似明朝的大炮，督工在荒郊研究试练。
四月，努\尔哈赤因宁远之败而怨恨喀尔喀阴助明朝，发兵第二次讨伐蒙古喀尔喀巴林部。内喀尔喀兵败，其首领卓里克图败走西拉木伦河时遇到林丹汗，林丹汗严厉责备卓里克图对自己的不忠，以及喀尔喀在明朝和金国之间朝秦暮楚之事，并趁火打劫，合并了他的余部。至此，内喀尔喀五部之一的炒花部不
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