岳飞虽奉旨尽力指挥属下将士与金军作战，但终因金军入侵势头太过强劲，双方兵力较为悬殊，最后楚州未能守住。金人得楚州后南渡灭南宋之意更甚，又继续挥师而下，不久后连破泰州与通州两城。赵构命宣抚处置使张浚自秦州退军兴州，调兵与岳飞协同作战，回临安之期也暂且不提，与宫眷在越州长住起来。
次年春正月元旦，赵构率百官遥拜二帝于行宫北门外。宋廷渡江以来本无此例，去年秦桧归来告知二帝消息后赵构遥拜过一次，而这年元旦后定为常例，以后每逢正月元旦都要举行这一仪式。随后赵构下诏改元为绍兴，升越州为绍兴府。绍兴元年二月，赵构任礼部尚书兼侍读秦桧为参知政事。
隆祐太后春秋已高，这几年历经忧患南北奔波，身体越来越不好，绍兴元年元月中先是受了些风寒，不想病势逐渐加重，到了四月间，太后全身忽冷忽热，头晕目眩胸闷乏力，不时便会晕厥过去。赵构大为着急，忙召御医前来诊治，那些御医知道赵构对太后最为孝顺，又顾及太后年高体弱，便不敢开药力较猛的药，生怕出一点差池，只开了些温补的药给太后服用。但太后服药后不但不见好反而越发难过，对赵构说：“如今我胸腹中似有火在烧一般，比有寒热之症时更觉不适。”赵构闻言又急又怒，下旨把御医重责几十杖轰出去，然后命人在绍兴府寻访名医为太后治病，自己则一连数夕与婴茀、柔福等人侍奉在太后病榻前，衣不解带地连夜守护，惟恐太后病情再恶化。
无奈事不如人愿，只过了两日太后寒热再度发作，病势比以前严重数倍，日夜发热而不退，神志渐不清醒，口中频频作呓语。赵构好不容易才找到江南名医夏振国入宫医治，夏振国为太后诊过脉象后告诉赵构：“太后患的是类疟症，平日所受风寒郁结于脏腑间。本来无甚大碍，以药引导，助风寒慢慢发泄出来即可，但此前用的全是温补之药，把风寒又遏阻在了胸腹间，就如强以木板压住正在燃烧的旺火，现在热已入心，已病至膏肓了。草民不才，已无力回天。”
赵构忙挽住他，连连劝他再想办法勉定一方，务必要将太后治好。夏振国摇头道：“治病救人本来就是医家职责，若有一线生机敢不尽力挽救？草民医道不精，的确是束手无策，只能奉上以毕生心血药草精华炼出的至宝丹一粒，请皇上待太后醒来后将此丹冲化，让太后服下。若守到明晨太后病势不生巨变，或许就还有救治的希望。”
说完夏振国拱手告退再不肯多作任何承诺，赵构只好命人开宫门放他出去，然后愁眉不展地
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