杨集这只蝴蝶扇了几下翅膀，却在大隋王朝引起了一场轩然大波。大业元年春，皇帝杨广大刀阔斧的改组大隋中枢行政机构，先是将内廷的侍奉机构内侍省改为长秋监，不仅在名义上将其与政务处理国事的门下、内史、尚书区分，还把长秋监等主官的官阶合理下降。接着，又明确了秘书省的职司，令其专门掌管图书、校正图籍；遇朝有制度沿革﹑礼仪轻重时，得以参议，但平时却无参政议政权，也就是说，曾与三省并驾齐驱的秘书省将会淡出人们的视线，成为了一个闲散的官署。
与此同时，又将先帝时期的十一寺改为九寺五监，这九寺五监在职级上，基本和尚书省六部平级，与尚书六部没有隶属关系，但职权与六部重叠之多，实际存在分工和制约关系。六部主管政令，九寺五监分别负责某方面的具体事务。
杨广之所以这么做，是对进行中中枢重复官署的撤并，企图裁剪冗官冗吏、提升办事效率。但九寺五监的存在一面是协助三省六部更好处理国这事务。只因三省六部大多都只能处理内部、中枢和一些紧急事情，并也只能粗略处理，而一些不紧急和一些需要细微处理的事情则由九寺五监等专属机构处理。
另一方面虽出于分权制衡的需要，三省六部本身就体现君王的了分权意识，而九寺五监则是进一步分割了三省六部制的权力，从而加强了中央集权，巩固大隋统治。
最重要的就是九寺五监都有存在的合理性，只因九寺五监都是一些专业性较强部门，比如说国子监的专业是掌控官学；比如说都水监，它掌河渠、津梁、堤堰、治水等事务；比如说少府监，它掌管大隋百工技巧诸务、负责各种研发，只要它正式成立起来，并将最出色的工匠收入其中，这个部门一定会成为大隋王朝最厉害的科技研发部门……所以为了更好服务和处理相关政务，的确有必要单独划分出来，如今经过杨广这般明确化，便能有效的降低了外行指挥内行等事件的出现，同时也更显专门化、职业化、规模规范化。
军事上，杨广将十二卫府增改为十二卫四府﹐合称十六卫。其十二卫为左右翊卫（原左右卫府）﹑左右骁（骑）卫﹑左右武卫（原左右武卫府）﹑左右屯卫（原左右领军府），左右候卫（原左右武侯府）和左右御卫（新置）；四府为左右备身府（原左右领左右府）和左右监门府。十二卫统全国府兵、宿卫京城，居中御外，卫戍京师，是府兵和禁军的合一；四府不统府兵，左右备身府负责侍卫皇帝；左右监门府分掌宫殿门禁。
若是在平时，杨广这一
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